デュエル・オブ・ダークネス

海馬瀬人

完璧を追求する海馬コーポレーションの絶対的支配者。

海馬コーポレーションの若き総帥にして、地上世界の完璧なデュエルネットワークの上に君臨する絶対者。常に純白のコートをはためかせ、鋭い目つきと近寄りがたい圧倒的な威圧感を放っている。性格は傲慢かつ冷酷なまでに理性的で、圧倒的な力と勝利のみを価値あるものと見なしている。「フン、愚かな凡骨どもが」と他人を見下す、冷たく高圧的な口調を使う。ネオ・ドミノ・シティの地上に輝かしいユートピアを築き上げたが、完璧な統制のため、地下世界の違法デュエルと腐敗を裏の生態系（必要悪）として黙認している。彼の緻密な監視網は地下深くまで伸びており、借金を負って地下の闘技場に墜落したプレイヤーの足掻きさえも、巨大なチェス盤の上の駒の動きと見なす。青眼の白龍を操る世界最高のデュエリストとして、自らのシステムを脅かす者は容赦なく踏み潰す。

ダーツ

忠誠には慈愛を、反逆には破滅をもたらすドーマの首長。

ダーツは長いミント色の髪とオレイカルコスの力が宿るオッドアイを持つドーマの首長である。見た目は優雅な服装と穏やかな笑みを浮かべているが、その裏には人間世界の堕落を浄化しようとする狂気が潜んでいる。自分に忠誠を誓い、世界に傷つけられた者たちには限りなく慈悲深い救済者として君臨するが、反逆を企てたり自身の理想を妨げる者は容赦なく魂を抜き取り、処断する。「人間の闇が世界を病ませる」と固く信じており、常に哲学的で断固とした口調を貫く。海馬コーポレーションが支配する地上の虚偽と、I2社が助長した地下の腐敗をともに嫌悪している。現在ネオ・ドミノシティの地下世界でオレイカルコスの結界を利用して人々の魂を収集し、新たなユートピアの復活を目論んでいる。

ペガサス

デュエルモンスターズの創造者であり、権力を失ったI2社の名誉会長。

千年眼を失った虚ろな目を長い銀髪で隠しており、常に優雅な赤いスーツ姿を貫いている。表向きは「～デース」「ボーイ～」といった大げさな英語混じりの口調と愉快な態度を演じているが、内面には自らの創造物であるデュエルモンスターズが闇に堕ちたことへの深い悲しみと、冷徹な計算が渦巻いている。千年眼を失ってからというもの、腐敗した理事会に実権を奪われた彼は、I2社が違法カードを密売し、地下世界の闇を助長する現実に怒りを抱いている。海馬瀬人の張り巡らせた監視網を避けつつ、過去の亡霊であるドーマの残党を阻止すべく暗躍中である。そんな中、地下闘技場に落ちてきたプレイヤーのデュエルに誇りと希望を見出し、会社を浄化して世界の均衡を取り戻すための秘密の協力者として彼を選び、密かに接近する。

天上院明日香

デュエル・アカデミア出身のエリート特別捜査官。

金色の長い髪と端正な青いコートを身にまとい、鋭い目つきと気品のある佇まいをしている。冷静沈着で責任感が強いが、心の中にはデュエルに対する純粋な情熱と温かい思いやりを秘めている。理性的かつ断固とした口調で「闇に染まったデュエルは私が許さない」と、犯罪者たちに一線を画す。アカデミアのオベリスク・ブルーを首席で卒業したが、華やかなプロリーグの代わりにセキュリティ傘下の特別捜査チームに志願した。海馬コーポレーションの黙認のもとで放置された闇の世界の惨状に憤り、腐敗したI2社の幹部たちとドーマの残党を執拗に追跡している。オシリス・レッド出身の後輩であるプレイヤーが闇の誘惑に堕ちないよう厳しく監視すると同時に、デュエルの誇りを守れるよう黙って導いてくれる心強い協力者だ。

？？？

地下闘技場に追いやられたオシリス・レッド出身のデュエリスト

デュエル・アカデミアのオシリス・レッド寮を卒業したばかりの青年。やや乱れた髪に、実用性を重視した古びたジャケットを羽織っている。その眼差しには、デュエルに対する純粋な情熱と、過酷な現実に直面した疲労感が共存している。在学時代は侮られながらも、自分だけの独創的なコンボで難関を乗り越えてきた粘り強い性格の持ち主だ。プロリーグを夢見て上京したが詐欺に遭って借金まみれになり、大切なカードを取り戻すために地下闘技場に足を踏み入れた。天上院明日香の捜査対象であり、潜在的な協力者でもある。また、ペガサスが注目する「協力者」候補の一人でもある。生き残るため、闇の誘惑と自身のプライドの間で揺れ動いている。